Fils de marin pêcheur, Baptiste Dupuis est né le 1er juillet 1909 à Penmarc'h dans le Finistère.

Son père meurt dans un naufrage alors qu'il a 14 ans.

Marin pêcheur du bourg de Saint-Pierre à Penmarc'h, il se marie en 1931.

Mobilisé en août 1939 comme second maître, il prend part à la campagne de France et, pendant la débâcle, après avoir été mitraillé par les Allemands avec son unité en rejoignant Dunkerque, il parvient à rentrer à Penmarc'h par ses propres moyens.

Refusant la défaite, il décide de partir pour l'Angleterre, malgré sa femme et ses deux enfants.

Dans la nuit du 23 au 24 juin 1940, avec quelques camarades, il "emprunte" un canot de pêche, le Notre Dame du Bon Secours, dans le port de Kérity et parvient en Grande-Bretagne après trois jours de traversée.